Germany – Custom software development services – Kartierung neuronaler Verbindungen - ein "Konnektom"

Prozessierung sensorischer Reize durch neuronale Schaltkreise im optischen Tektum der Zebrafischlarve ist die Kartierung neuronaler Verbindungen (ein "Konnektom") essenziell. Die Erstellung eines solchen Konnektoms ist auf Grundlage 3-dimensionaler elektronenmikroskopischer Daten möglich. Stand der Technik ist hierbei, eine automatische Detektion von Neuronen-Fragmenten ("Segmentierung") durchzuführen, die dann von menschlichen Annotatoren korrigiert und komplettiert wird ("proofreading"). Eine solche Segmentierung des Gehirns der Zebrafisch-Larve, sowie zugehörige Proofreading-Software, wurde vor Kurzem von Wissenschaftlern des MPI-BI veröffentlicht. Nun sollen diese Werkzeuge eingesetzt werden, um neuronale Schaltkreise im optischen Tektum detailliert zu kartieren. Dazu ist ein Team von Annotatoren notwendig.